La Zona del Valle del Mezquital ha sido considerada como una de las zonas más contaminadas del planeta. Se le ha denominado como un "infierno ambiental" debido a la concentración de corredores industriales, el desague de las aguas negras que llegan de la Ciudad de México, la presencia de un importante complejo industrial energético.

El Río Santiago atraviesa en El Salto y Juanacatlán una de las regiones industriales más importantes de Jalisco. Desde la segunda mitad del siglo XX, la expansión del Corredor Industrial Ocotlán–El Salto convirtió al río y a varios de sus afluentes en receptores de descargas industriales, aguas residuales urbanas, residuos agropecuarios y otros contaminantes. Un inventario oficial realizado en 2006 identificó 305 fuentes de contaminación en cuatro municipios de la cuenca, de las cuales 271 eran industriales. Estudios posteriores documentaron metales pesados, compuestos orgánicos tóxicos, contaminación microbiológica y cientos de sustancias químicas en el sistema hídrico. Las comunidades de El Salto y Juanacatlán han denunciado durante décadas afectaciones al agua, aire, salud y formas de vida. Organismos de derechos humanos estatales, nacionales e internacionales han reconocido la gravedad del caso. A pesar de nuevas inversiones y programas de saneamiento entre 2025 y 2026, la contaminación persiste y el territorio continúa sometido a presión industrial, urbana e infraestructural.

Querétaro se ha convertido en el principal nodo de infraestructura digital de México. Microsoft, Google Cloud, Amazon Web Services, Ascenty y otras empresas ya operan instalaciones en el estado, mientras nuevos proyectos anuncian una expansión considerable de la capacidad instalada. En septiembre de 2025 el gobierno federal anunció, dentro del Plan México, una inversión de 4,800 millones de dólares de CloudHQ para construir seis centros de datos sobre 52 hectáreas. La expansión ocurre en una región sometida periódicamente a sequía y con comunidades que reportan problemas de abastecimiento de agua, cortes eléctricos y poca información sobre los requerimientos reales de las instalaciones.